骷髅相关的谜题是游戏进程的重要阻碍，需要玩家掌握特定技巧才能顺利通过。骷髅谜题通常出现在游戏的中后期关卡，例如第11关和第12关，涉及骷髅头的摆放、移动石条获取骷髅头以及使用骷髅头解开后续机关等环节。这些谜题设计精巧，需要玩家仔细观察环境细节并合理运用道具。
面对骷髅头的摆放谜题时，玩家需要遵循特定规则才能成功。在塔外的骷髅堆场景中，系统会要求玩家放入蓝宝石头骨、翡翠头骨和黑曜石头骨三种特定类型的骷髅头。摆放时必须确保相同类型的头骨不会水平或垂直相邻，这需要玩家通过交换位置来调整排列。例如将第一排第三个红色头骨与第二排第二个白色头骨交换，再将第一排第四个红色与第三排第三排绿色头骨交换，最终达成所有同类头骨互不接触的状态。完成此操作后可获得镜子、弓箭手嵌片和石头葡萄等关键道具。
获取骷髅头的过程往往伴随着复杂的石条移动谜题。在官邸大门楼梯左侧的植物条场景中，玩家需要使用园艺剪刀剪断障碍后进入石条小游戏。该游戏要求玩家通过点击黄色标记部位，逐步移开所有阻挡的石条。策略上可以先保留三条关键石条，再点击中间石条完成最终移动。这个环节考验玩家的空间逻辑能力，需注意每次点击都会引发连锁移动反应，建议在操作前先观察石条之间的联动关系。
骷髅头作为关键道具，其后续应用涉及多个机关解谜。在庭院场景的右盘机关处，放置骷髅头后会提示缺少字母项链。需要返回官邸大门楼梯右侧的鸟窝，完成包含12个宝石的连线游戏，用紫色羽毛清除蜘蛛网，用汤匙处理苔藓，并给鸟类喂食鱼饵才能获得字母链。将字母链与骷髅头组合后，可开启地牢入口这一新区域。整个过程体现了游戏道具的多重交互特性，强调物品的组合使用价值。
地牢区域的探索需要配合其他道具才能完全解锁。在地牢入口左侧石块处可获得第一个宝石和石书，同时要记得在宫邸大门楼梯左侧墙上取得雕刻工具和煤炭。这些物品用于制作点燃的火把，是解决最终机关的必要条件。整个骷髅相关谜题链的设计具有严密的逻辑递进关系，每个步骤都建立在前置条件的基础上，要求玩家保持连贯的思维并做好关键道具的收集管理。通过系统性的观察和合理的物品使用顺序，最终能成功克服所有骷髅相关的挑战。
